Б. М. Шапошников внёс значительный вклад в теорию и практику строительства
Вооружённых сил СССР, в их укрепление и совершенствование, подготовку военных кадров. Он много и успешно работал над развитием военной науки, над обобщением боевого опыта
Первой мировой и
Гражданской войн. Участвовал в комиссии по разработке уставов, отражая в них основные положения
военной доктрины СССР. В наиболее известном труде «Мозг армии» определил основные положения о характере будущей войны, глубоко раскрыл особенности руководства армией в войне и дал чёткое представление о роли, функциях и структуре
Генерального штаба как органа
Верховного Главнокомандования по управлению Вооружёнными силами. Правильность его выводов подтвердила
Великая Отечественная война. Б. М. Шапошников отмечается в военной истории как выдающийся военный теоретик, талантливый практик, хорошо знающий оперативно-стратегические вопросы.
Пользовался большим уважением
Сталина. Борис Михайлович (наряду с
Рокоссовским) был одним из немногих, к кому тот обращался по имени и отчеству, а не «товарищ Шапошников», как к остальным руководителям страны и армии. С конца 1930-х годов он был одним из главных советников Сталина по военным вопросам.
Умер от тяжёлой болезни, не дожив 44 дня до
Победы. После смерти в
1945 был кремирован, прах помещён в урне
в Кремлёвской стене на Красной площади в Москве.