William e Anne se casaram em 1582. O casal teve três filhos: Susanna, em 26 de maio de 1583, que se casou em 1607, aos 24 anos, com John Hall, um médico de Stratford e tiveram uma filha, Elizabeth, e o casal de gêmeos Hamnet e Judith, em 1585, Judith casou-se com Thomas Quiney, um taberneiro, e teve três filhos que morreram antes de se casarem, porém Judith morreu aos 77 anos. Já Hamnet, morreu no verão de 1596, aos onze anos de idade.

Especula-se que o casamento de Anne e Shakespeare teria sido forçado pelo clã dos Hathaway, visto que ao se casarem ela já estava grávida, sendo que ele tinha somente dezoito anos de idade enquanto ela já contava com vinte e seis. Posteriormente Anne Hathaway aparece em alguns dos escritos de seu famoso esposo. No entanto, o consenso geral é de que pouco se sabe sobre a vida particular de Anne Hathaway.