O
Campeonato Brasileiro da Série B de 2006 foi a segunda divisão do Campeonato Brasileiro de Futebol naquele ano. Vencido pelo
Atlético Mineiro, que conseguiu o acesso a Série A após ter sido rebaixado em 2005. Os outros clubes que galgaram o acesso à primeira divisão de 2007 foram o
Sport Recife,
Náutico e
América de Natal. Esse último disputou a vaga com o
Paulista de forma emocionante até os minutos finais da última rodada, conseguindo também o fato histórico do bi-acesso ao ser promovido pelo segundo ano consecutivo.
Quanto ao descenso, o
Guarani caiu para a Série C mesmo ganhando a última partida. O
Paysandu também foi rebaixado, sendo aquele o segundo rebaixamento consecutivo do clube, que disputara a Série A em 2005.
São Raimundo e
Vila Nova se juntaram a
Paysandu e
Guarani e caíram para a terceira divisão do Campeonato Brasileiro do ano seguinte.