A finalidade do LNCC é realizar pesquisas na área da Computação Científica. As linhas de pesquisa do laboratório se fixam em áreas interdisciplinares como biossistemas, bioinformática, biologia computacional, atmosfera e oceanos, meio ambiente e ciência multiescala. Estas linhas de pesquisa apoiam-se nas áreas de competência do LNCC como mecânica dos fluidos computacional, computação de alto desempenho, simulação de reservatórios de petróleo, otimização e análise não-linear de estruturas, sistemas e controle, análise numérica de equações diferenciais e análise de sensibilidade.