O seu reinado terminou com a
Revolução Russa de 1917, quando, tentando retornar do quartel-general para a capital, seu trem foi detido em
Pskov e ele foi obrigado a abdicar. A partir daí, o czar e sua família foram aprisionados, primeiro no
Palácio de Alexandre em
Tsarskoye Selo, depois na Casa do Governador em
Tobolsk e finalmente na
Casa Ipatiev em
Ecaterimburgo. Nicolau II, sua mulher, seu filho, suas quatro filhas, o médico da família imperial, um servo pessoal, a camareira da imperatriz e o cozinheiro da família foram executados no porão da casa pelos
bolcheviques na madrugada de 16 para
17 de julho de
1918. É conhecido que esse evento foi ordenado de Moscou por
Lenin e pelo também líder bolchevique
Yakov Sverdlov. Mais tarde Nicolau II, sua mulher e seus filhos foram canonizados como
neomártires por grupos ligados à Igreja Ortodoxa Russa no exílio.