O primeiro grande sucesso do grupo foi
Blood Sugar Sex Magik, lançado em 1991 e vendeu dezessete milhões de cópias em todo o mundo. Durante a turnê desse álbum,
John Frusciante deixou o grupo por ter lidado mal com o sucesso e seu vício em drogas aumentou, assim a banda recrutou
Arik Marshall para concluir a turnê. Depois
Dave Navarro entra na banda, gravando
One Hot Minute, os outros integrantes percebem que ele não tem o espirito eufórico da banda e ele por sua vez desliga-se dos peppers. Embora bem sucedido comercialmente, o álbum não conseguiu se igualar a aclamação crítica e popular de
Blood Sugar Sex Magik, vendendo menos da metade que esse. Navarro saiu do grupo logo após a turnê.
John Frusciante, recém saído da
reabilitação, voltou à banda em 1998 a pedido de Flea.
Californication, By the Way e
Stadium Arcadium continuaram o sucesso do grupo. Depois de uma turnê mundial, o grupo entrou em um hiato prolongado. Em 2009
John Frusciante anunciou que estava deixando a banda amigavelmente para se concentrar em sua carreira solo e
Josh Klinghoffer o substituiu. A banda lançou em Agosto de 2011 seu décimo álbum de estúdio
I'm with You, que conseguiu ficar em primeiro em 18 países.
O Red Hot Chili Peppers ganhou seis
Grammy Award (sem contar o de melhor produtor do ano, vencido por Rick Rubin em 2007 por produzir o Stadium Arcadium) e já vendeu mais de 80 milhões de discos em todo o mundo. Atualmente a Banda detêm o recorde de mais hits número 1 na
Alternative Songs (12), e mais semanas no topo dessa lista, além de ter nove singles no Top 40 do
Billboard Hot 100 (incluindo três no Top 10) e cinco singles número um na
Hot Mainstream Rock Tracks. Em 2008, receberam uma estrela na
Calçada da Fama de Hollywood. A banda foi ao
Hall da Fama do Rock em
2012.