A fundação dessa disciplina se baseia no fato de que, respeitadas certas premissas básicas em uma população (ausência de seleção natural e ausência de mutação no
locus em questão, ausência de migração e tamanhos populacionais infinitamente grandes, entre outras), as frequências dos alelos e dos pares de alelos (genótipos) podem ser calculadas segundo fórmulas derivadas do chamado
Princípio do Equilíbrio de Hardy-Weinberg:
Em um
locus com apenas dois
alelos segregando em uma população
diploide de reprodução sexuada, temos:
[f(A)= p] Frequência relativa de "A" (a probabilidade de que um alelo sorteado ao acaso na população seja "A")