Durante a Batalha do Camelo (Baçorá), acredita-se que Marwan ibn al-Hakam tenha atirado em seu general, Talhah, com uma flecha na coxa, matando-o. O motivo teria sido uma vingança por ele ter supostamente traído o terceiro califa, Otman. Na época, ele foi removido por Ali e só retomou o posto Muawiya I. Marwan também acabou eventualmente expulso da cidade quando Abdullah ibn Al-Zubayr se revoltou contra Yazid I. Marwan seguiu então para Damasco, onde ele se tornou o califa quando Muawiya II abdicou.

O curto reinado de Marwan foi marcado pela guerra civil entre os omíadas e também pela luta contra ibn Zubayr, que controlava Hejaz, Iraque, Egito e partes da Síria. Marwan conseguiu vencer a guerra civil, iniciando a linhagem dos marwanidas entre os califas omíadas. Ele também conseguiu recapturar o Egito e a Síria, mas não conseguiu derrotar ib Zubayr completamente.