O nome Ponte Preta se deve à existência da ponte construída no final do século XIX para ligar a cidade (então composta do atual Centro e mais poucos bairros) à região do Cemitério da Saudade. Como nessa época os trens ainda eram movidos a vapor, a fumaça expelida manchava as construções sob as quais passava. Por esta razão, usou-se alcatrão (material de cor preta) no revestimento da ponte. Isto marcou a construção e serviu de inspiração para a fundação do clube, em 11 de agosto de 1900.