Estrutura química refere-se tanto a geometria molecular quanto a estrutura eletrônica. A geometria molecular refere-se ao arranjo espacial das massas em uma molécula e as ligações eletronicas que mantém os átomos separados. Geometria molecular pode variar das muito simples, tais como as moléculas diatômicas do oxigênio ou hidrogênio, às muito complexas, tais como moléculas de cancêr e DNA Geometria molecular pode ser por flexibilidade representada usando uma fórmula estrutural. A estrutura de massa descreve a ocupação dos orbitais que compõe as células.