Агарак был основан в 1949 году как военный поселок, а в 1954 году получил статус посёлка городского типа. В
1990-х годах получил статус города. Население в Агарака в
1972 году составляло 3800 человек, в
1979 году – 4073 человек, по данным переписи
2001 года в городе проживало 4801 жителей.
Большая часть домов многоэтажные, из розового
туфа. Водоснабжение производится из артезианских источников.