Ряд источников утверждает, будто в годы войны Изетбегович был в рядах германской армии и служил в печально известной
дивизии СС «Ханджар». Никаких документальных подтверждений данной информации не существует. В конце
1990-х ставился вопрос о привлечении Алии Изетбеговича к ответственности перед
Гаагским трибуналом.