Образуется слиянием рек
Пяндж и
Вахш, впадает в
Аральское море, образуя
дельту. В среднем течении в Амударью впадают три крупных правых притока (Кафирниган, Сурхандарья, Шерабад) и один левый приток (Кундуз). Далее до
Аральского моря она не получает ни одного притока.