Антиох вернулся в
116 году до н. э. в
Сирию и предъявил права на престол. Страной тогда управлял его двоюродный (сводный) брат
Антиох VIII Грип. Началась междоусобная война, в которой в
112 году до н. э. погибла супруга Антиоха Клеопатра, убитая по приказу супруги Антиоха VIII Трифены. Через год Антиох разбил брата, захватил в плен и убил Трифену. В конце концов, страна была поделена между братьями. Антиоху достались
Келесирия и
Финикия.