Результатами раскопок существование бегемотовых доказано уже с периода
миоцена. Вплоть до
плейстоцена они были распространены также в
Европе и
Азии. Новейшие генетические исследования намекают на то, что бегемотовые — близкие родственники
китов, то есть были их сухопутными родоначальниками.