Площадь болот 53 тыс. км² (для сравнения: площадь
Швейцарии — 41 тыс. км²), протяжённость с запада на восток — 573 км, с севера на юг — 320 км, координаты — от 55°40' до 58°60' с. ш. и от 75°30' до 83°30' в. д.
Васюганские болота возникли около 10 тысяч лет назад и с тех пор постоянно увеличиваются — 75 % их современной площади было заболочено менее 500 лет назад. Болота являются основным источником пресной воды в регионе (запасы воды — 400 км³), здесь расположены около 800 тысяч небольших озёр, множество рек берут начало из болот, в частности: Ава,
Бакчар,
Большой Юган,
Васюган,
Демьянка,
Икса,
Кенга, Нюролька, Малый Тартас, Малый Юган,
Омь,
Парабель,
Парбиг, Тара,
Туй,
Уй,
Чая, Чертала, Чижапка,
Чузик,
Шегарка, Шиш.