Под начальством принца
Евгения сражался против турок, во время войны за испанское наследство — против французов; затем поступил на службу к польскому королю
Августу II. В
1726 назначен императорским послом в
Берлин. В
1737 действовал во главе императорских войск против турок, сначала с успехом, но вскоре вынужден был отступить за
Саву, за что по проискам его врагов был посажен в крепость. Вступление на австрийский престол
Марии-Терезии предоставило ему свободу; тем не менее, он перешел на службу к императору
Карлу VII, но после смерти последнего склонил его преемника Максимилиана III к заключению мира в
Фюссене (см.
Война за австрийское наследство). После этого Зекендорф жил в своём имении близ
Альтенбурга, где в
1758 Фридрих Великий, заподозрив его в враждебных
Пруссии сношениях с
Австрией, велел его арестовать; после 6 месячного заключения в крепости он был выпущен на свободу.