Известия о его жизни и трудах кратки и неточны. Будучи учеником поэта Филита Косского, он получил приглашение египетского правителя
Птолемея I приехать в Александрию, чтобы работать библиотекарем и обучать наследника престола. Так Зенодот стал первым руководителем
Александрийской библиотеки, где он смог проявить свои филологические способности. В его обязанности входили оценка качества поступающих в библиотеку рукописей и исправление ошибок в них. Важнейшим изобретением Зенодота был знак
ὀβελός в виде просто черты или черты с добавлением точек по одной сверху и снизу. Знак помещался на полях рукописи напротив строки, которую филолог считал сомнительной. Не исключено, что Зенодоту принадлежит разделение «Илиады» и «Одиссеи» на 24 книги (которые часто неточно называют песнями).