Став королевой, она скоро привлекла к себе сердца подданных и примкнула к партии реформ. Когда король осенью
1806 года выступил в поход, она последовала за ним в
Тюрингию. После битвы при Иене она бежала, с детьми, в
Кёнигсберг, затем в
Мемель (январь
1807).
Наполеон преследовал королеву, которую считал зачинщицей войны, самыми недостойными оскорблениями. Несмотря на это, королева решила лично просить Наполеона в
Тильзите о более мягких условиях мира, но её усилия были напрасны.