При
Борисе Годунове Романовы подверглись опале. Сыновья
Никиты Романовича, Фёдор, Александр, Михаил, Иван и Василий, были пострижены в монахи и сосланы в
Сибирь в
1601 г. В
1605 г.
Лжедмитрий I, желая на деле доказать родство с домом Романовых, вернул из ссылки оставшихся в живых членов фамилии. Были возвращены Фёдор Никитич (в монашестве
Филарет) с женой
Ксенией Ивановной (в монашестве Марфа) и детьми, и
Иван Никитич. Марфа Ивановна с сыном Михаилом поселились сперва в костромской
вотчине Романовых, селе Домнине, а затем укрывались от преследования польско-литовских отрядов в
монастыре св. Ипатия близ
Костромы.