Мустафа был энергичным и дальновидным политиком. Он пытался обновить армию и государственный аппарат, чтобы сократить отрыв между Османской империей и европейскими державами, в том числе
Россией.
Тем не менее в период его правления продолжался общий упадок, охвативший Османскую империю ещё в начале столетия. Попытки модернизации были недостаточными, чтобы остановить это развитие. Любые реформы или планы изменить административный
статус кво встречали яростное сопротивление консервативных
янычаров и
имамов. Мустафа III был вынужден заручиться поддержкой западных советников, чтобы провести реформу
пехоты и
артиллерии. Помимо этого, султан распорядился основать Академию математики, мореплавания и науки.