Миссионер Уильям Крук был в
1818 первым европейцем, поселившемся в районе сегодняшнего Папеэте. Таитянская королева Помаре IV также поселилась в этом месте и провозгласила его в
1830 столицей. Папеэте стал региональным центром торговли и транспорта. После колонизации
Францией и создания протектората в
1842 Папеэте остался столицей. В
1884 пожар разрушил большую часть города, а в
1906 большой ущерб нанёс
циклон.