Птолемей VI наследовал своему отцу
Птолемею V, умершему от яда, в возрасте 11 (или 12) лет. Из-за неполнолетия нового фараона регентом при нём была провозглашена его мать
Клеопатра I. После её смерти в 176 до н. э. место регента заняли евнух Евлей и келесириец Леней. Их попытки вернуть отнятые Селевкидами территории окончились провалом. Сирийский царь из династии Селевкидов
Антиох IV Епифан вторгся в Египет, ограбил храмы Дельты и даже принял титул фараона, однако так и не был коронован и утверждён в этой должности в Мемфисе. Александрийцы в ответ возвели на трон брата Птолемея Филометора,
Птолемея VIII Эвергета. Антиох, рассчитывавший развязать в Египте междоусобную войну, снова напал на Египет. Хотя он и был вынужден покинуть долину Нила в 168 до н. э., но египетско-сирийская война была им выиграна, и Кипр был присоединён к владениям Сирийских Селевкидов.