במדע הגנטיקה, חוה המיטוכונדרית או חוה המיטוכונדריאלית (באנגלית: Mitochondrial Eve) הוא כינוי פופולרי לאישה שחייתה לפני כ-100,000 עד 200,000 שנה, ככל הנראה בדרום או במזרח אפריקה, והייתה אם קדמונית משותפת של כל בני האדם החיים כיום דרך שושלות אמהיות בלבד. את קיומה של אישה זו ניתן להסיק מחקר השושלות של רצפי גנום מיטוכונדרי, אשר עובר בתורשה רק מצד האם, בשלמותו וללא שחלוף. חוה המיטוכונדרית מוגדרת כאם הקדמונית המאוחרת ביותר של כל רצפי הדנ"א המיטוכונדרי הנמצאים כיום באנושות.