Un
acide aminé protéinogène est un
acide aminé incorporé dans les
protéines lors de la
traduction de l'
ARN messager par les
ribosomes. Il existe en tout aminés protéinogènes, ce qualificatif étant forgé à partir de racines grecques signifiant précisément « qui donne naissance aux protéines ». Parmi ceux-ci, aminés, dits acides aminés standards, sont
encodés directement par un
codon de l'
ADN nucléaire. Deux autre acides aminés protéinogènes sont encodés indirectement par des
codons-stop qui sont recodés en codons d'acides aminés en présence de
séquences d'insertion particulières, appelées pour la
sélénocystéine et pour la
pyrrolysine. La pyrrolysine n'intervient que chez certaines
archées méthanogènes, de sorte que les
eucaryotes et les
bactéries n'utilisent que aminés protéinogènes.