Era figlia della regina/imperatrice Maria Teresa d'Austria e dell'imperatore Francesco Stefano di Lorena, era amante del disegno e soleva disegnare ritratti e scene della vita familiare. Fu la figlia preferita da Maria Teresa e questa predilezione venne dimostrata dalla possibilità, rarissima per l'epoca, datale di sposare chi voleva. Nonostante il parere di suo padre morto però nel 1765, che voleva farla sposare a suo nipote, Benedetto Maria Maurizio di Savoia, duca del Chiablese, figlio di sua sorella Elisabetta Teresa e del re di Sardegna Carlo Emanuele III.