Participou na expedição científica austríaca que visitou o Brasil nos anos de 1817 a 1821. Em 1828 foi nomeado director dos jardins do Palácio de Schönbrunn, nos arredores de Viena, passando a exercer as funções de jardineiro da corte dos Habsburgos. A partir de 1845, Schott dirigiu os jardins e a casa das feras do imperador austríaco, que transforma em 1852 no parque do Palácio de Schönbrunn, seguindo uma concepção à moda dos jardins ingleses da época. Introduziu em Viena diversas plantas brasileiras, as quais depois ganharam aceitação na Europa como plantas decorativas.

Schott também se dedicou ao estudo da flora dos Alpes instalando um jardim alpino no Palácio de Belvedere.