O grupo mais famoso de Isoetopsida são as "árvores de escamas" (ordem Lepidodendrales), que incluem Lepidodendron. Estas árvores maciças foram abundantes nas terras húmidas do Carbonífero. Isoetes é considerados por alguns o último vestígio de tais árvores fósseis, com as quais partilham algumas características pouco comuns incluindo o desenvolvimento de madeira e súber, um sistema de rebentos que funciona como raíz, crescimento bipolar e posição vertical.