El río Jefferson es un río del noroeste de los Estados Unidos, una de las tres fuentes que confluyen en Three Forks para dar nacimiento al río Misuri (juntamente con el río Madison y el río Gallatin). Tiene una longitud de 124 km, aunque con una de sus fuentes, el río Beaverhead, llega hasta los 362 km, convirtiéndose en la fuente más alejada del río Misuri.