Les
Chromalveolata réunissent les
Alvéolés et les
Chromistes dans un taxon dont le caractère monophylétique est contesté. Sa compréhension dépend de l'analyse qu'on a de la ou des endosymbioses chloroplastiques. Les Chromistes ont été élevés au rang de règne par
T. Cavalier-Smith et donc distingués des autres
Protistes ainsi que des
Algues, dont ils comportent plusieurs lignées. Le groupe pourrait être proche des
Plantes ou des
Rhizaria, en tout ou en partie.