Molekül, birbirine
bağlı gruplar halindeki atomların oluşturduğu
kimyasal bileşiklerin en küçük temel yapısına verilen addır. Diğer bir ifadeyle bir molekül bir bileşiği oluşturan atomların eşit oranlarda bulunduğu en küçük birimdir. Moleküller yapılarında birden fazla atom içerirler. Bir molekül aynı iki atomun bağlanması sonucu ya da farkı sayılarda farklı atomların bağlanması sonucu da oluşabilirler. Bir
su molekülü 3 atomdan oluşur; iki
hidrojen ve bir
oksijen. Bir
hidrojen peroksit molekülü iki hidrojen ve iki oksijen atomundan oluşur. Diğer taraftan bir
kan proteini olan gamma globulin 19996 sayıda atomdan oluşmakla birlikte sadece 4 çeşit farklı atom içerir; hidrojen,
karbon, oksijen ve
nitrojen. Molekülleri oluşturan kimyasal bağlara Moleküler bağlar denir. Bunlar
kovalent,
iyonik ve
metalik bağlardır.