La sélénocystéine (abréviations IUPAC-IUBMB : Sel et U) est un non standard dont l'énantiomère L est l'un des , encodé sur les ARN messagers par le codon-stop opale UGA en présence d'une séquence d'insertion dite . Il s'agit d'un analogue sélénié de la cystéine qui entre dans la constitution de certaines enzymes de la classe des oxydoréductases telles que la glutathion peroxydase, la thiorédoxine réductase, les iodothyronine désiodases ( et ), la glycine réductase ou encore la formiate déshydrogénase, qu'on nomme sélénoprotéines. On dénombre actuellement trois gènes codant des sélénoprotéines chez E. coli. Contrairement à la plupart des acides aminés non standards, qui n'appartiennent pas à la série des aminés codés directement par le code génétique, la sélénocystéine n'est pas formée après la traduction de l'ARNm, mais incorporée directement lors de la synthèse de la chaîne polypeptidique par le ribosome.