中華民國政府遷臺前,孫立人已赴臺灣任陸軍副總司令、陸軍訓練司令兼
第四軍官訓練班班主任;中華民國敗退至
台灣後,1950年4月,孫晉升陸軍總司令,致力於國軍的現代化事業。然而由於孫將軍是少數受美國軍事教育,又無加入
中國國民黨的將領,
1950年初若干美國已經解密文電顯示,美國駐台北武官確曾建議美方要求蔣介石離開台灣,另由親美人士繼起領導,並稱孫立人等對「託管」並不堅決反對云云。此外
麥克阿瑟曾會見訪日的孫立人,也多所慰勉。孫可能因此受到國府高層嚴重懷疑。加上
1949年前後,美國國內
台灣地位未定論甚囂塵上,美國國會與政府關於美軍執行台灣託管的聲浪不斷。當時位居
中華民國總統的蔣中正对孫疑虑重重,遂宣稱由情報機構獲悉美在台機關與孫立人頗多接觸。但遷台初期國民政府為爭
美援,仍留用孫將軍以取信美國。