La
baia di San Francisco è un
estuario poco profondo dove sfociano importanti fiumi della
California, per gettarsi poi nell'
oceano Pacifico; tra i fiumi ci sono il
fiume Sacramento e il
San Joaquín e altri dalle montagne della
Sierra Nevada. Tecnicamente il Sacramento sfocia nella baia di Suisin, che attraverso lo stretto di Carquines incontra con il fiume
Napa all'imbocco della baia di San Pablo, che a sua volta nella sua estremità meridionale si apre nella baia di San Francisco. Tuttavia è uso riferirsi all'insieme di tutte queste baie interconnesse con il nome di "baia di San Francisco".