Une
séquence Alu est un court fragment d'
ADN appartenant à la famille des
petits éléments nucléaires intercalés ou SINE (
short interspersed element). Elles sont caractérisées par la présence d'un site de restriction de l'
endonucléase de
restriction Alu I. Elle provient de la
rétrotransposition de l'ARN 7SL (qui fait partie du complexe de reconnaissance du peptide signal lors de la synthèse des protéines) qui a eu lieu chez l'ancêtre commun des
Euarchontoglires. Cette séquence a évolué en séquence Alu chez les primates. Elle est longue d'environ 300 pb et ne comporte aucun gène. On pense que certaines séquences Alu sont capables de se transposer dans le génome en utilisant la machinerie des éléments LINE-1, d'autres
séquences répétées appartenant à la famille des
longs éléments nucléaires intercalés.