Bir
mikroorganizma (
Yunanca mikrós; "küçük" ve
ὀργανισμός,
organismós;
canlı "organizma"'dan gelmektedir.) veya
mikrop (genellikle çıplak gözle görülemeyecek kadar küçük anlamında)
mikroskobik bir
organizmadır. Mikroorganizmaları inceleyen,
Anton van Leeuwenhoek'un kendi tasarımı olan bir
mikroskop kullanarak
1675'de mikroorganizmaları keşfetmesi ile başlayan bilim dalına
mikrobiyoloji denir.