Não obstante, havia outras questões mais profundas que giravam tanto em torno da
teologia quanto da
política. No plano político, Lutero havia desafiado a autoridade absoluta do
papa sobre a Igreja, ao afirmar que a venda de indulgências, autorizada e promovida pelo papa, estava errada. No nível teológico, Lutero afirmou que a salvação era alcançada somente pela fé (
sola fide), e não através dos mecanismos jurídicos da Igreja, ou por que as pessoas fizessem por merecê-la. Ele também desafiou a autoridade da Igreja, ao afirmar que todas as doutrinas e dogmas devem ser compatíveis com os ensinamentos da
Escritura (
sola scriptura).
Para proteger a autoridade do papa e da Igreja, bem como para manter rentável a venda de
indulgências, os oficiais da igreja convenceram
Carlos V que
Lutero era uma ameaça e a autorizar a sua condenação pelo Império. Lutero escapou à prisão e permaneceu em isolamento no castelo de
Wartburg por vários anos, onde continuou a escrever e traduzir a
Bíblia para o alemão.