В современной систематике эта группа не признается за полноправный
таксон, поскольку она явно сформирована «по остаточному принципу» — в неё попали все животные,
не имеющие позвоночника. С точки зрения современной систематики — это классический пример
парафилетической группы (в отличие от строго
монофилетических позвоночных). По современным представлением, животные, которых Ламарк отнёс к беспозвоночным, распределены по более, чем двадцати равноправным группам высокого ранга —
типам (наиболее крупные из которых —
членистоногие,
круглые черви и
моллюски). При этом
позвоночные составляют лишь один из подтипов в типе
хордовых, два других подтипа которого (
оболочники и
головохордовые) традиционно относят к беспозвоночным. К беспозвоночным относится порядка 97% описанных видов животных.