Ключевые станции метро соединены с массой других систем общественного транспорта: поездами, монорельсами,
Синкансеном и прочими. Самая используемая станция метрополитена — Синдзюку — пропускает примерно 2 миллиона пассажиров в день, являясь самой «занятой» и второй самой крупной станцией в мире.