נראה שיש שלוש קבוצות נפרדות של סובותניקים: הקבוצה הראשונה מכילה נוצרים שהחליטו על שמירת השבת כיום המנוחה, ועם הזמן קיבלו על עצמם מקצת ממצוות ה
יהדות; השנייה - "הסובותניקים הקראים", עזבו את הנצרות, עברו טקס גיור אולם מבססים את דתם על התנ"ך בלבד ולא קיבלו על עצמם את התורה שבעל פה; הקבוצה השלישית - סובותניקים שעברו גיור רבני.