پیوند پپتیدی یک پیوند شیمیایی بین دو مولکول است که گروه کربوکسیل یک مولکول با گروه آمین مولکول دیگر واکنش میدهد ایجاد میشود و به این وسیله یک مولکول آب آزاد میشود(سنتز آبدهی) و بیشتر میان دو اسید آمینه برقرار میشود. پیوند پپتیدی میان دو اسید امینهاست . اگر شمار اسید امینههایی که به یکدیگر پیوندمیخورند کم باشد به آن الیگو پپتید میگویند و اگر شمار اسید امینههایی که به یکدیگر پیوندمیخورند زیاد باشد به آن پلی پپتید میگویند .اگر وزن مولکولی یک زنجیره پپتیدی کمتر از ۱۰۰۰۰ باشد به آن پلی پپتید میگویند و اگر بیشتر از این باشد به آن پروتئین میگویند .