司马睿於建康建立
东晋,领土范围在中国南方。東晉也与十六国合称
东晋十六国。中原的世族及人民陸續南遷促進南方的發展。東晉皇權低落,主要由
世族掌權,由於軍權外重內輕,不少方鎮心懷野心,造成
王敦之亂、蘇峻之亂及桓溫專政。此時雖然陸續有北伐以收復失土,但是朝廷擔心野心家藉此擴張勢力,進而篡位,所以大多消極支持。
383年前秦出動舉國之師,意圖滅亡東晉。面對亡國之禍,東晉君臣一心,這是成立以來最團結的一次。
淝水決戰後前秦崩解,謝安、謝玄等人成功的收復大批失土。然而,後期又發生朋黨相爭及
桓玄篡位。由於平民負擔沉重,又發生
孫恩、盧循之亂。
譙縱亦據蜀地自立。最後
劉裕崛起,平定諸亂,並奪得皇位,進入了
南北朝時期。