種群遗传学（Population Genetics）又稱族群遺傳學或群體遺傳學，是研究在四种进化动力的影响下，等位基因的分布和改变。通俗而言，群体遗传学则是在群体水平上进行研究的遗传学分支。这四种进化动力包括：自然选择、基因漂变、突变以及迁移。它也研究种群的分类，以及种群的空间结构。同样的，它也是试图解释诸如适应和物种形成现象的理论。该学科的创始人是舍沃·怀特、J. B. S. Haldane和羅納德·費雪，他们也曾经为定量遗传学（quantitative genetics）的相关理论建立基础。它是遗传学的分支学科。
