Sten Sture den äldre hamnar i konflikt med kyrkan om testamentsrätten till kyrkor och kloster samt rätten till biskopstillsättningar. Han får riksrådet emot sig, när han utverkar tillåtelse av påven att tillsätta biskoparna i Linköping, Strängnäs och Åbo. Han har tidigare konfiskerat gods i Södermanland och behållit dem själv, istället för att, som utlovat, ge dem till Uppsala domkyrka.