De
configuratie van een
molecuul, of
moleculaire configuratie is de karakteristieke ruimtelijke rangschikking van de
atomen in dat molecuul. Deze rangschikking geldt alleen als de molecuuldelen een vaste positie ten opzichte van elkaar hebben die niet kan worden veranderd dan door het verbreken van een binding tussen twee atomen. Het simpelweg draaien om een
enkelvoudige binding wordt niet beschouwd als een aanpassing van de configuratie, maar wordt
conformatieverschil genoemd.