Foi beatificado, com o nome Francisco de Xavier pelo
Papa Paulo V a 25 de outubro de 1619 e canonizado pelo
Papa Gregório XV, a 12 de março de 1622, em simultâneo com Inácio de Loyola. Em 14 de dezembro de 1927 o Papa Pio XI proclamou Francisco Xavier, juntamente com Santa Teresinha do Menino Jesus, padroeiro universal das missões. O seu dia festivo é 3 de dezembro.