La saison 2006-2007 de la Ligue des Champions de l'EHF met 39 équipes européennes aux prises. Il s’agit de la édition de la Ligue des champions de l'EHF, anciennement Coupe d'Europe des clubs champions, organisée par l’EHF. Cette édition a vu le BM Ciudad Real remporter son premier titre aux dépens du Portland San Antonio et succède au FC Barcelone.