Marvel Millennium: Homem-Aranha foi uma das seis publicações originalmente lançadas pela Panini ao assumir a Marvel no Brasil (Homem-Aranha, Marvel 2002, Marvel Millennium: Homem-Aranha, Paladinos Marvel, X-Men e X-Men Extra), e foi uma das quatro publicações da Panini a alcançar a marca de 100 edições (sua última, por sinal), juntamente com as séries Homem-Aranha, X-Men e X-Men Extra.
A série foi publicada em dois formatos diferentes, no "formato millenium" (18,5 cm x 27,5 cm), da edição 1 à 19, e posteriormente em formato americano (17 cm x 26 cm), da edição 20 em diante.