Die Seille (deutsch: Sell) entspringt in der Nähe von Ladoye-sur-Seille. Bei Nevy-sur-Seille fließt sie mit einem gleichnamigen Quellbach zusammen, der seine Quelle bei Baume-les-Messieurs hat und daher auch Seille de Baume genannt wird. Sie durchfließt die französische Landschaft Bresse in den DépartementsJura (Region Franche-Comté) und Saône-et-Loire (Region Burgund). Nach einer Länge von 100 Kilometern mündet sie südlich von Tournus bei La Truchère von links in die Saône.