Un
flagel és un
orgànul amb forma de
fuet que usen molts
organismes unicel·lulars i uns pocs
pluricel·lulars. No obstant això, aquests orgànuls poden també estar implicats en altres processos. Aquest nom cobreix realment tres estructures diferents trobades en cadascun dels tres dominis. Els flagels
bacterians són els filaments helicoïdals que roten com caragols. Els flagels d'
Archaea són superficialment similars, però són diferents en molts detalls i considerats no homòlegs. Els flagels d'
Eukarya - aquells de cèl·lules
protista animals i vegetals - són complexes projeccions cel·lulars que assoten cap endavant i cap enrere. A vegades, aquest últim és anomenat
cili o
undulipodia per a accentuar la seva distinció.